ظہیر خان کی پیدائش 7 اکتوبر 1978 کو مہاراشٹر میں شری رامپور کے ایک مراٹهی مسلم خاندان ذکیہ اور بختیار خان کے یہاں ہوئی۔ ان کے دو بھائی بہن ذیشان اور انیس ہیں۔ انہوں نے نیو مراٹهی پرائمری اسکول اور شری رامپور میں کے جے سومیا سیکنڈری اسکول میں تعلیم حاصل کی۔
ظہیر خان سنہ 1996 میں ممبئی آئے اور نیشنل کرکٹ کلب میں شمولیت حاصل کی۔ اس کے بعد جلد ہی انہوں نے بڑودہ کے ساتھ فرسٹ کلاس کرکٹ کی شروعات کی۔ انہوں نے سال 2000-2001 میں رنجی ٹرافی میچ کھیلا۔ ریلوے کے خلاف انہوں نے اپنی شاندار کارکردگی پیش کی جس کے لیے انہیں مین آف دی میچ قرار دیا گیا۔ اس کے بعد 2005 میں ورسسٹر شائر کونٹی کلب میں لندن میں کھیلے۔ انڈین پریمیر لیگ میں بھی ظہیر خان نے رائل چینلجز، ممبئی انڈین اور دہلی ڈیئر ڈیولس کی جانب سے اپنی بہترین کارکردگی پیش کی۔
سنہ 2000 میں نیروبی میں ہونے والی آئی سی سی ناک آؤٹ ٹرافی میں کینیا کے خلاف اپنے ایک روزہ بین الاقوامی میچ کی شروعات کی تھی اس کے بعد سے انہوں نے 120 ون ڈے میچوں میں 177 وکٹ لینے کے ساتھ 506 رن بنائے ہیں۔ جس میں ان کا بہترین کارکردگی 5/42 شامل ہے۔ سال 2003 میں ہونے والے کرکٹ ورلڈ کپ میں، ان کی شراکت کی وجہ سے بھارت فائنل میں پہنچنے میں کامیاب ہوا تھا جس میں انہوں نے سب سے زیادہ چار وکٹ لیے تھے۔ سال 2003 کے ورلڈ کپ میں ظہیر خان نے 11 میچوں میں 18 وکٹ لیے تھے، جن میں ان کی اوسط 20 رنز فی وکٹ تھا۔